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合併に伴う新「枝幸町」町長選挙は平成18年4月16日投票、即日開票され、旧「枝幸町」町長の荒屋吉雄（あらや・よしお、61）氏が、新人の長岡義昭（ながおか・よしあき、49歳）前枝幸町議会議員を破り初代の新「枝幸町」町長に当選した。
荒屋氏は、昭和19年2月1日生、枝幸町出身、枝幸高卒。昭和36年同町役場入り、農林課長、水産港湾課長、財政課長、南宗谷消防組合消防長。平成15年2月枝幸町長に就任。18年3月19日合併に伴い町長失職（任期満了は平成19年2月1日まであった）。
有権者数 7,980人 投票者数 7,218人 投票率 90.45％ 無効票 77票 当選 荒屋 吉雄 4,186票 長岡 義昭 2,955票